Что представляет собой жидкость в транспортной среде вируса? Почему он красный?

Тест на нуклеиновые кислоты, как следует из названия, представляет собой сбор нуклеиновых кислот (с использованием мазков из носа или ротоглотки) и затем амплификацию с помощью ПЦР для обнаружения присутствия целевой последовательности, чтобы определить, присутствует ли вид. С момента вспышки Covid-19 эта технология постепенно привлекала внимание общественности.

После того, как биологический образец собран, очень важно обеспечить сохранность нуклеиновой кислоты. Однако подобно бактериям отслоившиеся клетки и другие секреторные компоненты могут иметь активные ингредиенты, которые катализируют расщепление нуклеиновых кислот. В частности, генетическим материалом Covid-19 является РНК, которая слабее ДНК и легче поддается лизису.

Таким образом, у вирусной транспортной среды (VTM) есть только одна миссия - сохранить генетический материал в тестируемом образце неповрежденным. Его можно разделить на две транспортные среды в зависимости от того, инактивирован ли он.

Инактивированная транспортная среда

Самый простой метод — убить все вирусы и клетки и ингибировать все потенциальные РНК-гидролазы. Например, поверхностно-активные вещества/соли для лизиса используются для разрушения мембранной структуры вирусов/клеток, так что вирусные белки теряют физиологическую активность. Ферменты ингибируются солями гуанидина (например, изотиоцианатом гуанидина) для защиты нуклеиновой кислоты, подобно лизату для экстракции нуклеиновой кислоты (реагент TRIzol). Он обычно используется для рутинных биологических испытаний, чтобы избежать риска аэрозольного заражения трансмиссивными вирусами.

Тип инактивации лизиса без гуанидина: добавляется агент, денатурирующий белок, не содержащий гуанидиновой соли, который лизирует вирус, инактивирует его и высвобождает нуклеиновые кислоты в раствор. Нет необходимости в экстракции нуклеиновой кислоты, подходящей для прямой амплификации ПЦР (но ее растворимость и способность к денатурации относительно слабы по сравнению с солями гуанидина).

Неинактивированная транспортная среда

Неинактивирующие транспортные среды изготавливаются из органических растворителей и инертных материалов, предназначенных для поддержания жизнеспособности клинических образцов, содержащих вирусы. Они подавляют микробное загрязнение и защищают образцы во время транспортировки и обработки. Основными компонентами транспортной среды для инактивированных вирусов являются базальные сбалансированные солевые растворы Хенкса. Амфотерицин В добавляют для ингибирования конкурирующих бактерий и дрожжей. Буфер HEPES используется для поддержания надлежащего уровня pH.

Приоритет должен отдаваться личной защите, поскольку неинактивируемый VTM содержит жизнеспособные вирусы/бактерии. Существует риск заражения исследователя. В то же время для эффективной консервации требуется дорогостоящая транспортировка холодовой цепи. Его можно использовать для выделения вирусов, культивирования и разработки вакцин.

Обзор

Хотя эти две транспортные среды служат схожим целям, все же существуют некоторые принципиальные различия. В то время как неинактивированный VTM стабилизирует жизнеспособность клеток/вирусов и предотвращает размножение бактерий, инактивированный VTM защищает нуклеиновые кислоты от вирусов и клеточных заболеваний.

Индикатор pH обычно добавляют в раствор, чтобы визуально наблюдать за состоянием раствора (при разных значениях pH цвета меняются).

 Натриевая соль фенолового красного (CAS: 34487-61-1) широко используется в качестве индикатора pH. Раствор красный в нейтральной среде, желтый в кислой и фиолетовый в щелочной. Раствор станет желтым, если раствор заражен бактериями и уровень pH снизится. Если вы добавите уксус в этот раствор красного цвета фуксии, он должен стать желтым, чтобы друзья с условиями могли его протестировать.

«HCY, Здравоохранение для вас» — наша вечная миссия. Мы стремимся предлагать безопасные и надежные продукты и медицинские услуги с нашими надежными партнерами по всему миру. HCY уже поставляла ВОЗ, клинику MAYO, MGI, DDC, Йельский университет, Qorvo, Quanterix, Thomas Scientific, биосенсор SD, Cardinal Health, Cleveland Clinic, Mars Petcare & LumiraDx и т. д. в последние годы.